正磷酸是由一个单一的磷氧四面体构成的磷酸。在磷酸分子中P原子是sp杂化的，3个杂化轨道与氧原子间形成3个σ键，另一个P—O键是由一个从磷到氧的σ配键和两个由氧到磷的d-pπ键组成的。σ配键是磷原子上的一对孤对电子向氧原子的空轨道配位而形成。d←p配键是氧原子的py、pz轨道上的两对孤对电子和磷原子的dxz、dyz空轨道重叠而成。由于磷原子3d能级比氧原子的2p能级能量高很多，组成的分子轨道不是很有效的，所以P—O键从数目上来看是三重键，但从键能和键长来看是介于单键和双键之间。这可能是磷酸浓溶液之所以粘稠的原因。
1） 除氟和硅： 湿法磷酸中的氟， 通常以SiF6形式存在， 工业生产常加入钠盐 （例如NaCl）或者钾盐，与之形成难溶的Na2SiF6或K2SiF6沉淀，经过滤分离即可除去氟和硅。
2） 除硫酸根：加入钙盐（要求不高时）或钡盐（要求较高时） ，与之形成难溶的CaSO4或 BaSO4沉淀，经过滤分离即可除去。
3） 除铁、铝、镁：加入碱性物（例如Na2CO3、NH3等）与湿法磷酸进行部分中和（PH ＝2.5～3.0） ，形成一系列非水溶性铁、铝、镁磷酸盐的复杂化合物，经过滤分离即可除 去。
磷酸的主要作用：
1、磷酸是生产重要的磷肥(过磷酸钙、磷酸二氢钾等)的原料，也是生产饲料营养剂(磷酸二氢钙)的原料。
2、处理金属表面，在金属表面生成难溶的磷酸盐薄膜，以保护金属免受腐蚀。
3、和酸混合作为化学抛光剂，用以提高金属表面的光洁度。
4、生产洗涤用品、虫剂的原料磷酸。
5、生产含磷阻燃剂的原料。
6、磷酸是食品添加剂之一，在食品中作为酸味剂、酵母营养剂，可乐中就含有磷酸。磷酸盐也是重要的食品添加剂，可作为营养增强剂。
7、磷酸可用于制取含磷，例如甘油磷酸钠等。
磷酸铵是生产混 合肥料的一种理想的基础肥料。磷酸铵中氮素为铵态氮，磷素几乎都是水溶态，适合于各种作物和土壤施用，应深施。因磷酸铵的含磷量为含氮量的3～4倍，故除了豆科作物之外，施用时必须配施一定量纯 氮肥。正磷酸与氨反应时因中和程度不同，生成三种盐类，即 磷酸一铵、 磷酸二铵、磷酸三铵。磷酸三铵的性质很不稳定，在 常温下放出氨而变成 磷酸二铵。磷酸铵是二元 复合肥料。其中磷酸一铵纯品含氮(N)12.17%，含磷(P)61.71%，商品磷酸一铵无统一规格，一般为11-52-0。磷酸二铵纯品含氮(N)21.71%，含磷(P)53.75%，商品 磷酸二铵的规格为18-46-0或16-48-0。